蜂蜜与四叶草第二季是由长井龙雪  笠井贤一  铃木洋平  秋田谷典昭  高岛大辅  上田繁  池端隆史  浅野胜也  福田道生  执导，神谷浩史  工藤晴香  前田忧佳  高桥美佳子  杉田智和  大原沙耶香  堀内贤雄  藤原启治  竹若拓磨  等人主演的，于2006年上映，该动漫讲述的是：美术大学五人组的故事仍在继续。竹本（神谷浩史 配音）结束了寻找自我的单车之旅，在盛放烟火的晚上对阿久（工藤晴香 配音）说出了那句“我喜欢你。”山田（高桥美佳子 配音）依旧陷在单恋真山（杉田智和 配音）的泥沼中，野宫（滨田贤二 配音）的出现成了泥沼里一株逃脱的稻草；真山则继续追寻着理花（大原沙耶香 配音），胜利的曙光在不远处；森田（上田佑司 配音）和阿久，两个天才的兮兮相惜，能否换来最后的相守。　　时间在四季轮回中流逝，微小的变化一点点积攒成为不可忽视的转折点。五人都面临着新的人生，各奔东西。已逝去的奇迹般的岁月，并不会消失，而成为永久的回忆，在内心转动。改编自同名漫画的《蜂蜜与四叶草》故事也走向终点，但对于他们，这则是新的起点。